Berlin’in en eski üniversitesi olan Berlin Humboldt Üniversitesi, 181 senesinde Berlin yakınlarındaki Potsdam’da dünyaya gelmiş olan devlet adamı, felsefeci ve dilbilimci Wilhelm von Humboldt tarafından kurulmuştur. Okul, Almanya ulusal birliğini henüz oluşturmamışken zamanının Prusya’sında kurulmuştur. Orijinal dildeki adı “Humboldt-Universität zu Berlin”dir. Amerika Birleşik Devletleri’nin Kaliforniya eyaletinde yer alan Humboldt Devlet Üniversitesi (Humboldt State University) ile karıştırılmaması gerekir.

Humboldt Üniversitesi’nden geçen öğrencilere bakıldığında Batı düşünce tarihini en çok etkilemiş insanların önemli bir kısmı göze çarpacaktır. Fichte, Hegel, Schelling, Schopenhauer gibi düşünürler , Max Planck ve Albert Einstein gibi bilim insanları, Bismarck ve Liebknecht gibi devlet adamları bu okulun eski öğrencilerindendir. Ayrıca Friedrich Engels ve Karl Marx da bu okulda okumuşlardır.

Okul iki kere isim değişikliğine gitmiş, 1828 ve 1949 yılları arasında önce Frederick William Üniversitesi sonra da Universität unter den Linden ismiyle anılmıştır. Ancak 1949 senesinde kurucusunun adını alarak Humboldt-Universität zu Berlin şeklinde isimlendirilmiştir.

Okulun şöhreti uluslararası alanda oldukça iyidir. Dünya’da en iyi 100 üniversiteden biridir.  Okul temel olarak Felsefe, Tarım, Matematik ve Doğa Bilimleri, İlahiyat ile Ekonomi ve İş Yönetimi Fekültelerine ayrılıyorsa da çağdaş üniversitelerdeki hemen hemen her bölüm bu fakülteler altında yerini almıştır.